En 868, l’église St Jean de Chaussan fut confirmée aux chanoines de St Irénée et de St Just par l’archevêque de Lyon.
En 1228 Hugues de Rechagnieu, chevalier, vend à l’église de St Just tout ce qu’il avait de droit sur la dîme de Chaussan.
Ce monument qui était une ancienne forteresse a été incendié par les Tards-Venus en 1364. Seguin de Badefol, leur chef, mit le feu à l’édifice après y avoir rassemblé et violenté la population venue s’y réfugier.
Au XVIème siècle, cette église servit d’abri aux habitants pendant les guerres civiles. Née d’un mélange de style entre art ogival (c’est-à-dire gothique) et renaissance, cette église est composée de murs crénelés et d’un clocher carré du XVème siècle.
En 1669, le décimateur de la paroisse, le Chapitre de Saint Just, permet la reconstruction du sanctuaire. Puis, au fil des années, chacune des parties sera réparée.